Klinika prowadzi diagnostykę i specjalistyczne leczenie dzieci z chorobami nowotworowymi, zwłaszcza układu krwiotwórczego (białaczki) i układu chłonnego (nieziarnicze chłoniaki, choroba Hodgkina), a także z licznymi guzami litymi (m.in. neuroblastoma, rhabdomyosarcoma, retinoblastoma). Ponadto Klinika obejmuje opieką dzieci z nienowotworowymi chorobami układu krwiotwórczego, m.in. z niedokrwistościami, skazami krwotocznymi, neutropeniami, histiocytozą i innymi. Dzięki współpracy z innymi Klinikami i Zakładami szpitala możliwe jest szybkie ustalanie rozpoznań. 

Stosowane przy udziale Kliniki Chirurgii Dziecięcej i Zakładu Radioterapii, stale ulepszane sposoby kompleksowego leczenia (chemioterapia, chirurgia, radioterapia), są oparte na doświadczeniach przodujących w świecie ośrodków onkologii i hematologii dziecięcej. Współpraca z uniwersyteckimi ośrodkami w naszym kraju, zrzeszonymi w Polskich Pediatrycznych Grupach ds. Leczenia Białaczek i Chłoniaków oraz ds. Leczenia Guzów Litych, pozwala na szybką wymianę doświadczeń i niezwłoczne wprowadzanie optymalnych modyfikacji leczenia. Wysokowykwalifikowani lekarze, pielęgniarki, rehabilitanci, psycholodzy, dietetycy i pracownicy socjalni zapewniają dzieciom fachową i troskliwą opiekę. Ulepszane postępowanie wspomagające zapobiega coraz skuteczniej powikłaniom, w tym bólowi i zakażeniom. Dzieci wymagające długotrwałego leczenia mają zakładane dożylne cewniki centralne. Pacjenci wymagający szczególnej opieki (np. skrajna neutropenia) przebywają w jednoosobowych salach intensywnego nadzoru. Współczesne leczenie prowadzone w Klinice pozwala na uzyskanie całkowitych wyleczeń u około 70% dzieci z chorobą nowotworową. Postęp w terapii z każdym rokiem daje szansę na dalszą poprawę wyników. W Poradni przyklinicznej kontynuuje się leczenie, zarówno nowotworów, jak i nienowotworowych chorób krwi oraz prowadzone są konsultacje onkologiczne i hematologiczne. Pacjenci po zakończeniu leczenia nowotworów obejmowani są wieloletnią opieką ambulatoryjną. Oferowane są im różnorodne formy pomocy